Hola Orensano92, te explico ahora mismo tu duda, ten en cuenta en primer lugar que comisión de servicios NO es una situación administrativa, sino una forma de provisión de puestos de trabajo, dicho esto, cuando un funcionario se mueve dentro de una misma Administración Pública y obtiene un puesto de trabajo a través de una comisión de servicio, en todo momento su situación administrativa es la de SERVICIO ACTIVO.
Sin embargo en el ejemplo que tu nos comentas hay dos Administraciones Públicas (AGE y XUNTA), por lo tanto el funcionario quedará respecto de su Administración de origen (AGE) en situación administrativa de Servicio en otras Administraciones Públicas y respecto de su Administración de destino (XUNTA) en situación administrativa de Servicio Activo.
Espero que todo esté mas claro ahora.
Un saludo.